Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2bQ9JME9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vstm2bQ9JME9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vstm2bQ9JME9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vstm2bQ9JME9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm2bQ9JME9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm2bQ9JME9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm2bQ9JME9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm2bQ9JME9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm2bQ9JME9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm2bQ9JME9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm2bQ9JME9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm2bQ9JME9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm2bQ9JME9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm2bQ9JME9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm2bQ9JME9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm2bQ9JME9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm2bQ9JME9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm2bQ9JME9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm2bQ9JME9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm2bQ9JME9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm2bQ9JME9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm2bQ9JME9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms