Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms