Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms