Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Msrb1Q9JLC3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Msrb1Q9JLC3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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