Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Nectin3Q9JLB9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Nectin3Q9JLB9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Nectin3Q9JLB9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Nectin3Q9JLB9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Nectin3Q9JLB9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Nectin3Q9JLB9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Nectin3Q9JLB9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Nectin3Q9JLB9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Nectin3Q9JLB9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Nectin3Q9JLB9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Nectin3Q9JLB9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Nectin3Q9JLB9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Nectin3Q9JLB9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Nectin3Q9JLB9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nectin3Q9JLB9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nectin3Q9JLB9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nectin3Q9JLB9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nectin3Q9JLB9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nectin3Q9JLB9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nectin3Q9JLB9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nectin3Q9JLB9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nectin3Q9JLB9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nectin3Q9JLB9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nectin3Q9JLB9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nectin3Q9JLB9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nectin3Q9JLB9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nectin3Q9JLB9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nectin3Q9JLB9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nectin3Q9JLB9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nectin3Q9JLB9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nectin3Q9JLB9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nectin3Q9JLB9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nectin3Q9JLB9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nectin3Q9JLB9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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