Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prg3Q9JL95 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms