Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rfx5Q9JL61 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rfx5Q9JL61 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rfx5Q9JL61 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rfx5Q9JL61 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rfx5Q9JL61 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rfx5Q9JL61 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rfx5Q9JL61 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rfx5Q9JL61 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rfx5Q9JL61 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rfx5Q9JL61 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rfx5Q9JL61 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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