Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms