Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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