Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms