Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Nova1Q9JKN6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nova1Q9JKN6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nova1Q9JKN6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nova1Q9JKN6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nova1Q9JKN6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nova1Q9JKN6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nova1Q9JKN6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nova1Q9JKN6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nova1Q9JKN6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nova1Q9JKN6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nova1Q9JKN6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nova1Q9JKN6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nova1Q9JKN6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nova1Q9JKN6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nova1Q9JKN6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nova1Q9JKN6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nova1Q9JKN6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nova1Q9JKN6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms