Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms