Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms