Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms