Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms