Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJJ7

Porcn, Protein-serine O-palmitoleoyltransferase porcupine, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PorcnQ9JJJ7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PorcnQ9JJJ7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PorcnQ9JJJ7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PorcnQ9JJJ7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PorcnQ9JJJ7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PorcnQ9JJJ7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PorcnQ9JJJ7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PorcnQ9JJJ7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PorcnQ9JJJ7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PorcnQ9JJJ7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PorcnQ9JJJ7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PorcnQ9JJJ7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PorcnQ9JJJ7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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PorcnQ9JJJ7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms