Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms