Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms