Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
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Rb1cc1Q9ESK9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
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Rb1cc1Q9ESK9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
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Rb1cc1Q9ESK9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
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Rb1cc1Q9ESK9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
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Rb1cc1Q9ESK9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
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Rb1cc1Q9ESK9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
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Rb1cc1Q9ESK9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rb1cc1Q9ESK9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
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