Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lima1Q9ERG0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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