Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr61Q9ERF3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms