Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms