Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms