Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms