Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Smg9Q9DB90 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Smg9Q9DB90 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Smg9Q9DB90 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Smg9Q9DB90 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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