Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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