Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms