Protein–RNA interactions for Protein: Q9D991

1700123K08Rik, RIKEN cDNA 1700123K08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123K08RikQ9D991 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700123K08RikQ9D991 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms