Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SlirpQ9D8T7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SlirpQ9D8T7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SlirpQ9D8T7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SlirpQ9D8T7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SlirpQ9D8T7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SlirpQ9D8T7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SlirpQ9D8T7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SlirpQ9D8T7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SlirpQ9D8T7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SlirpQ9D8T7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SlirpQ9D8T7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SlirpQ9D8T7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SlirpQ9D8T7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SlirpQ9D8T7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.7 ms