Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gtf3c6Q9D8P7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gtf3c6Q9D8P7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gtf3c6Q9D8P7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gtf3c6Q9D8P7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gtf3c6Q9D8P7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gtf3c6Q9D8P7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gtf3c6Q9D8P7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gtf3c6Q9D8P7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gtf3c6Q9D8P7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gtf3c6Q9D8P7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c6Q9D8P7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gtf3c6Q9D8P7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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