Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ifi35Q9D8C4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms