Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp5Q9D7S9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms