Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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