Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Borcs6Q9D6W8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms