Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm3404Q9D506 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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