Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms