Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms