Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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