Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms