Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed11Q9D2R4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms