Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms