Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms