Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Batf3Q9D275 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Batf3Q9D275 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms