Protein–RNA interactions for Protein: Q9D180

Cfap57, Cilia- and flagella-associated protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap57Q9D180 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap57Q9D180 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap57Q9D180 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap57Q9D180 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap57Q9D180 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap57Q9D180 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap57Q9D180 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap57Q9D180 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap57Q9D180 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap57Q9D180 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap57Q9D180 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap57Q9D180 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap57Q9D180 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap57Q9D180 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap57Q9D180 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap57Q9D180 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap57Q9D180 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfap57Q9D180 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms