Protein–RNA interactions for Protein: Q9D103

Ifitm1, Interferon-induced transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm1Q9D103 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ifitm1Q9D103 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Ifitm1Q9D103 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Ifitm1Q9D103 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifitm1Q9D103 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms