Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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