Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms