Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms