Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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