Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms